c07_volcano 高通量组学 (Omics) Nature Cell Lancet

差异表达火山图 (Volcano Plot) High-Throughput Volcano Plot with Collision-Free Gene Labeling

转录组/蛋白质组差异表达高通量火山图,内置 adjustText 防重叠算法与显著性双阈值截断线。

携带样例一键进 Studio
预载标准示例 · 浏览器秒级出图

统计学特性 (Statistical Features)

  • log2(Fold-Change)
  • -log10(p-value / FDR)
  • 双阈值四象限分类
  • 显著差异基因计数统计

QC 质检要点 (QC Highlights)

  • 核心候选基因标签 0 重叠碰撞
  • 阈值虚线标注清晰
  • 点半透明防止海量数据完全掩盖
  • 高分辨率矢量导出
顶刊色彩提取器 (Palette Extractor)Nature

Crisp sans-serif typography, clean borderless spines, high-contrast palette with soft muted secondary accents.

审稿无障碍视觉模拟 (SVG Filter):
无障碍评分:AAA (Deuteranopia & Protanopia Compliant)

Data Contract 数据契约规范 Strict Schema

输入数据必须完全符合下列列名与数据类型规范,方可通过自动化数据前检 (Pre-flight Validation)。

字段名称 (Column) 数据类型 (Type) 约束性 语义说明与值域约束
gene_symbol string 必需 (Required) Gene or probe identifier (e.g., TP53, EGFR)
log2FC continuous 必需 (Required) log2(Fold Change) effect size
pvalue continuous 必需 (Required) Raw or nominal p-value (min: 0, max: 1)
padj continuous 可选 (Optional) FDR adjusted p-value / q-value
is_highlight boolean 可选 (Optional) Flag to force text label placement
组内最小样本量: n ≥ 10
最大允许缺失率: 5%

独立可复现 Python 绘图源码 Stand-alone Script

完全可复现的 Python 脚本,支持 CLI 参数 `--data`, `--style`, `--output-dir` 与模块化 `render()` 调用。

#!/usr/bin/env python3
"""FigureCraft Chart Engine: Volcano Plot with Collision-Free Gene Labeling (c07_volcano)."""

import os
import sys
import argparse
from pathlib import Path
from typing import List, Dict, Optional
import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
from adjustText import adjust_text

try:
    from engines.styles import apply_style, get_palette
except ImportError:
    # ── Standalone fallback ── runs without FigureCraft engine install ──
    # Includes 6 journal palettes. For full rcParams fidelity (font stacks,
# ... [Academic Pro 完整独立可复现源码已锁定]

此脚本内置 6 种期刊配色规范,复制即可本地直接运行。如需免配置直接交互运行? 携带样例一键进 Studio 在线运行 · 获取完整工业级工程包(含逐期刊字体栈与批量渲染 CLI)请查看 源码工程包。

学术成果引用规范 (Cite FigureCraft)Citable Paradigm

在毕业论文、SCI 期刊发表或学术预印本中使用本套件产出图表时,请按规范引用。

@software{figurecraft2026,
  author    = {{FigureCraft Core Team}},
  title     = {FigureCraft: In-Browser Publication-Grade Scientific Data Visualization Suite and Multi-Agent Skills Hub},
  year      = {2026},
  url       = {https://figure-craft.pages.dev},
  version   = {1.0.0},
  note      = {WebAssembly-powered client-side reproducible scientific plotting engine}
}
遵循标准学术开源许可,完全支持 LaTeX、Overleaf、Zotero、EndNote 与 Google Scholar
DOI: 10.5281/zenodo.figurecraft.2026